En 1993, Capcom conclut un partenariat avec Marvel et édite Punisher, basé sur la BD éponyme. Ce partenariat renouvelé conduira à un grand nombre de jeux basés sur l'univers Marvel et Capcom jusqu'en 2017. Je ne vais pas faire ici l'éxégèse de cette franchise, mais Marvel Vs. Capcom: Clash of Super Heroes sorti en 1998 sur la plateforme CPS-2 de Capcom est en somme le troisième épisode. On retrouve entre comme l'Homme Araignée ou Serval, opposés à des personnages de l'univers Capcom.
La plateforme CPS-2 est assurément l'une des plus belles réussites de Capcom en matière de PCB. Les jeux sont nombreux, variés, superbes. Ils n'ont jamais été copiés, grâce à un hardware extrêmement intégré et à un mécanisme de protection très élaboré.